Curso GRATUITO sobre la secuenciación del genoma (bioinformática II)

La secuenciación de genomas es un proceso que determina el orden o la secuencia de los nucleótidos (p. ej., A, C, G y T/U) en cada uno de los genes presentes en el genoma del virus. 

Es posible que haya escuchado mucho sobre la secuenciación del genoma y su potencial para marcar el comienzo de una era de medicina personalizada, pero ¿qué significa secuenciar un genoma?

Los biólogos todavía no pueden leer los nucleótidos de un genoma completo como leerías un libro de principio a fin. Sin embargo, pueden leer fragmentos cortos de ADN.

 En este curso, veremos cómo se puede utilizar la teoría de grafos para ensamblar genomas a partir de estos breves fragmentos. Aprenderemos más sobre los algoritmos de fuerza bruta y los aplicaremos a la secuenciación de mini-proteínas llamadas antibióticos.

En la primera mitad del curso, veremos que los biólogos no pueden leer los 3 mil millones de nucleótidos de un genoma humano como leerías un libro de principio a fin. Sin embargo, pueden leer fragmentos más cortos de ADN.

 En este curso, veremos cómo se puede utilizar la teoría de grafos para ensamblar genomas a partir de estas piezas cortas en lo que equivale al rompecabezas más grande jamás creado.

En la segunda mitad del curso, hablaremos de los antibióticos, un tema de gran relevancia ya que las bacterias resistentes a los antimicrobianos como MRSA están en auge. 

Conoces a los antibióticos como drogas, pero a nivel molecular son miniproteínas cortas que han sido diseñadas por bacterias para matar a sus enemigos. 

La determinación de la secuencia de aminoácidos que componen uno de estos antibióticos es un problema de investigación importante, similar al de secuenciar un genoma mediante el ensamblaje de pequeños fragmentos de ADN. 

Veremos cómo los algoritmos de fuerza bruta que prueban todas las soluciones posibles son capaces de identificar antibióticos de origen natural para que puedan sintetizarse en un laboratorio.

Por último, aprenderá a aplicar herramientas de software de bioinformática populares para secuenciar el genoma de una bacteria Staphylococcus mortal que ha adquirido resistencia a los antibióticos.

Lo que aprenderás:

• Semana 1: Introducción a la secuenciación del genoma
  • ¡Bienvenido a clase!

Este curso se enfocará en dos preguntas a la vanguardia de la biología computacional moderna, junto con los enfoques algorítmicos que usaremos para resolverlas entre paréntesis:

1. Semanas 1-2: ¿Cómo ensamblamos los genomas? ( Algoritmos de gráficos )
   1. ¿Cómo secuenciamos los antibióticos? ( Algoritmos de fuerza bruta )

Cada uno de los dos capítulos de contenido de la clase está acompañado por una caricatura bioinformática creada por el talentoso artista de San Diego, Randall Christopher, y que sirve como encabezado de capítulo en el compañero de impresión más vendido de la especialización. 

Puede encontrar la caricatura del primer capítulo al final de este mensaje. ¿Qué tiene que ver un viaje de una máquina del tiempo a 1735, una pila de periódicos, un rompecabezas y una hormiga gigante que invade una ciudad ribereña con la creación de un genoma? 

¡Empiece a aprender hoy para averiguarlo!

• Semana 2: Aplicación del teorema de Euler para ensamblar genomas
  • ¡Bienvenidos a la semana 2 de clase!

Esta semana en clase, veremos cómo un teorema matemático de 300 años nos ayudará a ensamblar un genoma a partir de millones de diminutos fragmentos de ADN.

• Semana 3: secuenciación de antibióticos
  • ¡Bienvenidos a la semana 3 de clase!

Esta semana, comenzamos un nuevo capítulo, titulado “¿Cómo secuenciamos los antibióticos?” En este capítulo, aprenderemos cómo determinar las secuencias de aminoácidos que componen los antibióticos utilizando algoritmos de fuerza bruta.

A continuación se muestra la caricatura de bioinformática de esta semana.

Semana 4: de los espectros ideales a los reales para la secuenciación de antibióticos

• ¡Bienvenidos a la semana 4 de clase!

La semana pasada, discutimos cómo secuenciar un péptido antibiótico de un espectro ideal. 

Esta semana, veremos cómo desarrollar algoritmos más sofisticados para la secuenciación de péptidos antibióticos que sean capaces de manejar espectros con muchas masas falsas y faltantes.

• Semana 5: ¡Desafío de la aplicación de bioinformática!
  • ¡Bienvenidos a la semana 5 de clase!

    Esta semana, veremos cómo aplicar las herramientas de ensamblaje del genoma para secuenciar datos de una peligrosa bacteria patógena.

¿Cómo obtengo el curso?

Este curso es ofrecido desde la plataforma de Coursera, es un curso que puedes obtener de manera gratuita bajo ciertas condiciones.

La primera opción es elegir la opción de “Curso gratuito sin certificado”, de esta manera podrás acceder al contenido del curso y finalizarlo, pero no podrás obtener un certificado de finalización avalado por la plataforma.

La segunda opción es elegir “auditar curso”, con esta opción podrás acceder al contenido de video del curso, pero no podrás realizar los exámenes ni obtener el certificado de finalización. Si no ves la opción de auditar curso, debes verificar en la parte de abajo usando el scroll (en forma de link).

Las opciones varían dependiendo el curso, pero con cualquiera de las dos podrás acceder gratuitamente al contenido. Por si fuera poco, algunos cursos tienen la opción de ayuda económica, con los cuales puedes solicitar dicho apoyo y ser acreedor de un curso de pago.

Para obtener el curso de manera gratuita da clic en el siguiente botón:

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