Curso GRATUITO en español sobre la bioinformática bacteriana

La bioinformática es una derivación de las ciencias computacionales, involucrando elementos biológicos, químicos, bioquímicos, estadísticos y matemáticos que están enfocados al análisis de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas.

Este curso proporciona demostraciones y ejercicios para realizar tareas comunes de análisis basadas en genómica de datos de secuencia bacteriana. Utiliza PATRIC, el Centro de integración de recursos de PathoSystems, como plataforma para el análisis. PATRIC es el Centro de recursos de bioinformática bacteriana financiado por NIH / NIAID, que proporciona datos genómicos bacterianos completos con herramientas de análisis y visualizaciones integradas. PATRIC también proporciona un espacio de trabajo privado donde los usuarios pueden cargar y analizar sus propios datos.

Los participantes del curso obtendrán las habilidades necesarias para realizar análisis comparativos de genomas bacterianos, comenzando con datos de secuencia sin procesar. Las lecciones del primer módulo cubren el ensamblaje del genoma, la anotación, la construcción del árbol filogenético y las comparaciones de familias de proteínas / proteomas. Cada lección se basa en la anterior, creando un flujo de trabajo de análisis de línea de base completo.

Lo que aprenderás:

• Introducción:
  • Esta lección proporciona una introducción a PATRIC, el Centro de Integración de Recursos de PathoSystems, un Centro de Recursos Bioinformáticos dedicado a apoyar la investigación bacteriana. PATRIC proporciona datos genómicos bacterianos completos con visualizaciones y herramientas de análisis integradas.

PATRIC también proporciona un espacio de trabajo privado donde los usuarios pueden cargar y analizar sus propios datos. PATRIC servirá como plataforma para los métodos de análisis cubiertos en este módulo.

• Montaje:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para ensamblar un genoma a partir de un conjunto de lecturas de secuencias bacterianas utilizando el Servicio de ensamblaje de genomas PATRIC. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso del proceso de ensamblaje.
• Anotación:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para anotar un genoma de contigs utilizando PATRIC Genome Annotation Service. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso del proceso de anotaciones.
• Análisis completo del genoma:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para ensamblar, anotar y realizar un análisis automatizado de un genoma a partir de un conjunto de lecturas de secuencias bacterianas utilizando el servicio de análisis integral del genoma PATRIC. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso del servicio.

• Árboles fiogenéticos basados ​​en codones:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para generar un árbol filogenético basado en codones a partir de un conjunto de genomas utilizando PATRIC Codon Tree Service. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso del servicio.
• Buscador de genomas similares:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para encontrar genomas (y taxonomía asociada) en PATRIC similares a su genoma o secuencias usando el servicio Similar Genome Finder. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso del servicio.
• Clasificador de familias de proteínas:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para usar el clasificador de familias de proteínas PATRIC para comparar la presencia, ausencia y recuento de proteínas en familias de proteínas en un conjunto de genomas. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso de la herramienta.
• Comparación de proteomas:
  • Esta lección proporciona instrucciones paso a paso para utilizar el Servicio de comparación de proteomas PATRIC para comparar un conjunto de genomas con un genoma de referencia, un grupo de características o un archivo FASTA. Se incluyen ejercicios para mejorar la comprensión y desarrollar la competencia en el uso de la herramienta.

¿Cómo obtengo el curso?

Este curso es ofrecido desde la plataforma de Coursera, es un curso que puedes obtener de manera gratuita bajo ciertas condiciones.

La primera opción es elegir la opción de “Curso gratuito sin certificado”, de esta manera podrás acceder al contenido del curso y finalizarlo, pero no podrás obtener un certificado de finalización avalado por la plataforma.

La segunda opción es elegir “auditar curso”, con esta opción podrás acceder al contenido de video del curso, pero no podrás realizar los exámenes ni obtener el certificado de finalización. Si no ves la opción de auditar curso, debes verificar en la parte de abajo usando el scroll (en forma de link).

Las opciones varían dependiendo el curso, pero con cualquiera de las dos podrás acceder gratuitamente al contenido. Por si fuera poco, algunos cursos tienen la opción de ayuda económica, con los cuales puedes solicitar dicho apoyo y ser acreedor de un curso de pago.

Para obtener el curso de manera gratuita da clic en el siguiente botón: